Xử lý nước có vấn đề khử trùng. Hiện nay, phương pháp khử trùng bằng clo và oxy hóa phổ biến là thêm clo hoặc clorua vào nước. Tuy nhiên, người ta phát hiện ra rằng quá trình khử trùng bằng clo sẽ dẫn đến việc sản sinh ra ba chất gây ung thư, gây quái thai và gây đột biến trong nước uống. Các phương pháp xử lý được phát triển trong những năm gần đây như tia cực tím, ozon, siêu âm, từ hóa và tĩnh điện chưa được sử dụng rộng rãi do thiết bị phức tạp, lưu lượng nước xử lý nhỏ hoặc chi phí xử lý cao. Điện phân là một loại công nghệ xử lý nước khử trùng phổ biến với hiệu quả khử trùng tốt, khả thi cao và không gây ô nhiễm thứ cấp. Sản xuất axit hypoclorơ bằng quy trình clo-kiềm đã được sử dụng rộng rãi. Theo phương pháp này, một dòng điện chạy qua một tế bào điện phân chứa dung dịch natri clorua (NaCl), cực dương tạo ra các ion clo (Cl-), và cực âm tạo ra các đơn vị điện phân ion hydroxit (OH+), cuối cùng tạo ra các chất bao gồm clorua ion, ion hydro và axit hypochlorous. Các ion clorua, axit hypochlorous, v.v. được tạo ra là những chất oxy hóa mạnh và không có tác dụng tiêu diệt mạnh đối với vi sinh vật.